Stouns se povredio tokom meča 19. kola Premijer lige protiv Evertona, kada je bio u duelu sa protivničkim napadačem Betom.
Stradao je skočni zglob i engleski reprezentativac je zamenjen u 43. minutu.
"Ne izgleda dobro, ali videćemo. Stouns je povredio skočni zglob", rekao je Gvardiola.
Španski stručnjak je 29-godišnjeg defanzivca šetao sa pozicije na poziciju, igrao je čak i zadnjeg veznog, ali je ove sezone upisao samo 12 nastupa zbog problema sa povredom kuka.
"Znam da mnogi sumnjaju u nas nakon što smo slavili samo jednom u šest utakmica, ali u Liverpulu smo pokazali da smo i dalje tu. Sve je u rezultatima, kada ne dobijate onda se sve osporava, trijumfi 'brišu' minuse."
Mančester siti je trenutno četvrti na tabeli Premijer lige sa 37 bodova.
"Bio nam je potreban ovaj meč, mislim da smo bili veoma dobri. Čak i u prvom poluvremenu kada smo gubili. U nastavku smo znali da moramo brže da napadamo, imali smo sreću da sa dva brza gola dobijemo ono što smo želeli", istakao je Gvardiola.